用代数拓扑与 Transformer 解决蛋白质 - 配体互作预测问题

果然看好的刊物总会让人心情愉悦而且有所启发。

Multiscale topology-enabled structure-to-sequence transformer for protein–ligand interaction predictions 是 NMI 上的一篇文章。

这个图很大，流程总结下来就是：

1. 将蛋白质配体结构转化成一个复形
2. 按照不同元素进行分离
3. 使用有向超图的拉普拉斯矩阵
4. 傅里叶变换转换成一维的波
5. 输入到 Transformer 中

大晚上的，也没看很仔细，不过感觉挺有意思的。

先这样吧。